Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V2

TRIML1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIML1Q8N9V2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIML1Q8N9V2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIML1Q8N9V2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIML1Q8N9V2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIML1Q8N9V2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIML1Q8N9V2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIML1Q8N9V2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIML1Q8N9V2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIML1Q8N9V2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIML1Q8N9V2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIML1Q8N9V2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIML1Q8N9V2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIML1Q8N9V2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIML1Q8N9V2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIML1Q8N9V2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIML1Q8N9V2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIML1Q8N9V2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIML1Q8N9V2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIML1Q8N9V2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIML1Q8N9V2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIML1Q8N9V2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIML1Q8N9V2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIML1Q8N9V2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIML1Q8N9V2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIML1Q8N9V2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIML1Q8N9V2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIML1Q8N9V2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIML1Q8N9V2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIML1Q8N9V2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIML1Q8N9V2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIML1Q8N9V2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIML1Q8N9V2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIML1Q8N9V2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIML1Q8N9V2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIML1Q8N9V2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIML1Q8N9V2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms