Protein–RNA interactions for Protein: Q8N806

UBR7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR7Q8N806 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
UBR7Q8N806 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms