Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC155Q8N6L0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC155Q8N6L0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms