Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6K7

SAMD3, Sterile alpha motif domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD3Q8N6K7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SAMD3Q8N6K7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SAMD3Q8N6K7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SAMD3Q8N6K7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SAMD3Q8N6K7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SAMD3Q8N6K7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SAMD3Q8N6K7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SAMD3Q8N6K7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SAMD3Q8N6K7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SAMD3Q8N6K7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SAMD3Q8N6K7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SAMD3Q8N6K7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SAMD3Q8N6K7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SAMD3Q8N6K7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SAMD3Q8N6K7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAMD3Q8N6K7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAMD3Q8N6K7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAMD3Q8N6K7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAMD3Q8N6K7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAMD3Q8N6K7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAMD3Q8N6K7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAMD3Q8N6K7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SAMD3Q8N6K7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAMD3Q8N6K7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAMD3Q8N6K7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAMD3Q8N6K7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAMD3Q8N6K7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAMD3Q8N6K7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAMD3Q8N6K7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAMD3Q8N6K7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAMD3Q8N6K7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAMD3Q8N6K7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAMD3Q8N6K7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAMD3Q8N6K7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAMD3Q8N6K7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SAMD3Q8N6K7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAMD3Q8N6K7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAMD3Q8N6K7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAMD3Q8N6K7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SAMD3Q8N6K7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SAMD3Q8N6K7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SAMD3Q8N6K7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SAMD3Q8N6K7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SAMD3Q8N6K7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms