Protein–RNA interactions for Protein: Q8N567

ZCCHC9, Zinc finger CCHC domain-containing protein 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC9Q8N567 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZCCHC9Q8N567 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZCCHC9Q8N567 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms