Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHCHD4Q8N4Q1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CHCHD4Q8N4Q1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms