Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.5 ms