Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SVBPQ8N300 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms