Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXH7

NELFCD, Negative elongation factor C/D, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCDQ8IXH7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NELFCDQ8IXH7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NELFCDQ8IXH7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms