Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT4

TRIM50, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM50, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM50Q86XT4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM50Q86XT4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM50Q86XT4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM50Q86XT4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM50Q86XT4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM50Q86XT4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM50Q86XT4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM50Q86XT4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM50Q86XT4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM50Q86XT4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM50Q86XT4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM50Q86XT4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM50Q86XT4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM50Q86XT4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM50Q86XT4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM50Q86XT4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM50Q86XT4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM50Q86XT4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM50Q86XT4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM50Q86XT4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM50Q86XT4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM50Q86XT4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM50Q86XT4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM50Q86XT4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM50Q86XT4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM50Q86XT4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM50Q86XT4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM50Q86XT4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM50Q86XT4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM50Q86XT4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM50Q86XT4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM50Q86XT4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM50Q86XT4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM50Q86XT4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms