Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALYREFQ86V81 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALYREFQ86V81 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms