Protein–RNA interactions for Protein: Q86V35

CABP7, Calcium-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP7Q86V35 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CABP7Q86V35 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CABP7Q86V35 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CABP7Q86V35 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CABP7Q86V35 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CABP7Q86V35 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CABP7Q86V35 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CABP7Q86V35 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CABP7Q86V35 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CABP7Q86V35 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CABP7Q86V35 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CABP7Q86V35 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CABP7Q86V35 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CABP7Q86V35 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CABP7Q86V35 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CABP7Q86V35 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CABP7Q86V35 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CABP7Q86V35 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CABP7Q86V35 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CABP7Q86V35 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CABP7Q86V35 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CABP7Q86V35 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CABP7Q86V35 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CABP7Q86V35 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CABP7Q86V35 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CABP7Q86V35 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CABP7Q86V35 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CABP7Q86V35 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CABP7Q86V35 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CABP7Q86V35 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CABP7Q86V35 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CABP7Q86V35 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CABP7Q86V35 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CABP7Q86V35 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CABP7Q86V35 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms