Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC29A4Q7RTT9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC29A4Q7RTT9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC29A4Q7RTT9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC29A4Q7RTT9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC29A4Q7RTT9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC29A4Q7RTT9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC29A4Q7RTT9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC29A4Q7RTT9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC29A4Q7RTT9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC29A4Q7RTT9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC29A4Q7RTT9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC29A4Q7RTT9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC29A4Q7RTT9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC29A4Q7RTT9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC29A4Q7RTT9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC29A4Q7RTT9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC29A4Q7RTT9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC29A4Q7RTT9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC29A4Q7RTT9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC29A4Q7RTT9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC29A4Q7RTT9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC29A4Q7RTT9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC29A4Q7RTT9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC29A4Q7RTT9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC29A4Q7RTT9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC29A4Q7RTT9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC29A4Q7RTT9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC29A4Q7RTT9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC29A4Q7RTT9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC29A4Q7RTT9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC29A4Q7RTT9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC29A4Q7RTT9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC29A4Q7RTT9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC29A4Q7RTT9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC29A4Q7RTT9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC29A4Q7RTT9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC29A4Q7RTT9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC29A4Q7RTT9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC29A4Q7RTT9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC29A4Q7RTT9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC29A4Q7RTT9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC29A4Q7RTT9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC29A4Q7RTT9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC29A4Q7RTT9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC29A4Q7RTT9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC29A4Q7RTT9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms