Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTOP1Q7RTM1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms