Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYDE1Q6ZW31 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYDE1Q6ZW31 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.4 ms