Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPGS1Q6ZTW0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPGS1Q6ZTW0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPGS1Q6ZTW0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms