Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN03

LINC00322, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00322, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00322Q6ZN03 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
LINC00322Q6ZN03 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00322Q6ZN03 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00322Q6ZN03 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00322Q6ZN03 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00322Q6ZN03 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00322Q6ZN03 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00322Q6ZN03 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00322Q6ZN03 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00322Q6ZN03 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00322Q6ZN03 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00322Q6ZN03 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00322Q6ZN03 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00322Q6ZN03 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00322Q6ZN03 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00322Q6ZN03 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00322Q6ZN03 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00322Q6ZN03 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00322Q6ZN03 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00322Q6ZN03 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00322Q6ZN03 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00322Q6ZN03 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00322Q6ZN03 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00322Q6ZN03 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00322Q6ZN03 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00322Q6ZN03 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00322Q6ZN03 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00322Q6ZN03 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00322Q6ZN03 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00322Q6ZN03 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00322Q6ZN03 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00322Q6ZN03 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms