Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN8

CCNI2, Cyclin-I2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNI2Q6ZMN8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCNI2Q6ZMN8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNI2Q6ZMN8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms