Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CASC2Q6XLA1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CASC2Q6XLA1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms