Protein–RNA interactions for Protein: Q6VY07

PACS1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1Q6VY07 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PACS1Q6VY07 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PACS1Q6VY07 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PACS1Q6VY07 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PACS1Q6VY07 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PACS1Q6VY07 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PACS1Q6VY07 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PACS1Q6VY07 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PACS1Q6VY07 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PACS1Q6VY07 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PACS1Q6VY07 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PACS1Q6VY07 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PACS1Q6VY07 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PACS1Q6VY07 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PACS1Q6VY07 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACS1Q6VY07 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACS1Q6VY07 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACS1Q6VY07 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PACS1Q6VY07 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACS1Q6VY07 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACS1Q6VY07 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACS1Q6VY07 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACS1Q6VY07 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACS1Q6VY07 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACS1Q6VY07 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACS1Q6VY07 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACS1Q6VY07 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACS1Q6VY07 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACS1Q6VY07 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACS1Q6VY07 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACS1Q6VY07 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACS1Q6VY07 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACS1Q6VY07 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACS1Q6VY07 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACS1Q6VY07 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACS1Q6VY07 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACS1Q6VY07 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PACS1Q6VY07 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACS1Q6VY07 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PACS1Q6VY07 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACS1Q6VY07 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACS1Q6VY07 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACS1Q6VY07 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACS1Q6VY07 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACS1Q6VY07 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACS1Q6VY07 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PACS1Q6VY07 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACS1Q6VY07 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PACS1Q6VY07 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PACS1Q6VY07 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms