Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXT8

ALKAL1, ALK and LTK ligand 1, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKAL1Q6UXT8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ALKAL1Q6UXT8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ALKAL1Q6UXT8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ALKAL1Q6UXT8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALKAL1Q6UXT8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALKAL1Q6UXT8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALKAL1Q6UXT8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ALKAL1Q6UXT8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALKAL1Q6UXT8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALKAL1Q6UXT8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALKAL1Q6UXT8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALKAL1Q6UXT8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALKAL1Q6UXT8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALKAL1Q6UXT8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALKAL1Q6UXT8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALKAL1Q6UXT8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALKAL1Q6UXT8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALKAL1Q6UXT8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALKAL1Q6UXT8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALKAL1Q6UXT8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALKAL1Q6UXT8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ALKAL1Q6UXT8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALKAL1Q6UXT8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALKAL1Q6UXT8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALKAL1Q6UXT8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALKAL1Q6UXT8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALKAL1Q6UXT8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms