Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
C16orf54Q6UWD8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms