Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCD3Q6STE5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCD3Q6STE5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms