Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC174Q6PII3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms