Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIF2

SYCE2, Synaptonemal complex central element protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE2Q6PIF2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCE2Q6PIF2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms