Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CSAG1Q6PB30 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms