Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TTC41PQ6P2S7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTC41PQ6P2S7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTC41PQ6P2S7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTC41PQ6P2S7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTC41PQ6P2S7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTC41PQ6P2S7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTC41PQ6P2S7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTC41PQ6P2S7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TTC41PQ6P2S7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTC41PQ6P2S7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTC41PQ6P2S7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTC41PQ6P2S7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTC41PQ6P2S7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTC41PQ6P2S7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTC41PQ6P2S7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTC41PQ6P2S7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTC41PQ6P2S7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTC41PQ6P2S7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTC41PQ6P2S7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTC41PQ6P2S7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTC41PQ6P2S7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TTC41PQ6P2S7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTC41PQ6P2S7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TTC41PQ6P2S7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTC41PQ6P2S7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTC41PQ6P2S7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTC41PQ6P2S7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTC41PQ6P2S7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTC41PQ6P2S7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTC41PQ6P2S7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTC41PQ6P2S7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTC41PQ6P2S7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTC41PQ6P2S7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTC41PQ6P2S7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TTC41PQ6P2S7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTC41PQ6P2S7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTC41PQ6P2S7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTC41PQ6P2S7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTC41PQ6P2S7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTC41PQ6P2S7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTC41PQ6P2S7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTC41PQ6P2S7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTC41PQ6P2S7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTC41PQ6P2S7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTC41PQ6P2S7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms