Protein–RNA interactions for Protein: Q6NY19

KANK3, KN motif and ankyrin repeat domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KANK3Q6NY19 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KANK3Q6NY19 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KANK3Q6NY19 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KANK3Q6NY19 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KANK3Q6NY19 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KANK3Q6NY19 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KANK3Q6NY19 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KANK3Q6NY19 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KANK3Q6NY19 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KANK3Q6NY19 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KANK3Q6NY19 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KANK3Q6NY19 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KANK3Q6NY19 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KANK3Q6NY19 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KANK3Q6NY19 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KANK3Q6NY19 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KANK3Q6NY19 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KANK3Q6NY19 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KANK3Q6NY19 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KANK3Q6NY19 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KANK3Q6NY19 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KANK3Q6NY19 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KANK3Q6NY19 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KANK3Q6NY19 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms