Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANKRD54Q6NXT1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ANKRD54Q6NXT1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms