Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms