Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMN6

CAPRIN2, Caprin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN2Q6IMN6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CAPRIN2Q6IMN6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPRIN2Q6IMN6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPRIN2Q6IMN6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPRIN2Q6IMN6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPRIN2Q6IMN6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPRIN2Q6IMN6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPRIN2Q6IMN6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPRIN2Q6IMN6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPRIN2Q6IMN6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPRIN2Q6IMN6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPRIN2Q6IMN6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms