Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRAMD4Q6IC98 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms