Protein–RNA interactions for Protein: Q6H8Q1

ABLIM2, Actin-binding LIM protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABLIM2Q6H8Q1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ABLIM2Q6H8Q1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ABLIM2Q6H8Q1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ABLIM2Q6H8Q1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ABLIM2Q6H8Q1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ABLIM2Q6H8Q1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ABLIM2Q6H8Q1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ABLIM2Q6H8Q1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ABLIM2Q6H8Q1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ABLIM2Q6H8Q1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ABLIM2Q6H8Q1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ABLIM2Q6H8Q1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ABLIM2Q6H8Q1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ABLIM2Q6H8Q1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ABLIM2Q6H8Q1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ABLIM2Q6H8Q1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ABLIM2Q6H8Q1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ABLIM2Q6H8Q1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ABLIM2Q6H8Q1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ABLIM2Q6H8Q1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ABLIM2Q6H8Q1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ABLIM2Q6H8Q1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ABLIM2Q6H8Q1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ABLIM2Q6H8Q1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ABLIM2Q6H8Q1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ABLIM2Q6H8Q1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ABLIM2Q6H8Q1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms