Protein–RNA interactions for Protein: Q6FHJ7

SFRP4, Secreted frizzled-related protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4Q6FHJ7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFRP4Q6FHJ7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFRP4Q6FHJ7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms