Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ANKRD40Q6AI12 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ANKRD40Q6AI12 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms