Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUPD1Q68J44 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUPD1Q68J44 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms