Protein–RNA interactions for Protein: Q63HM2

PCNX4, Pecanex-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX4Q63HM2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCNX4Q63HM2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCNX4Q63HM2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCNX4Q63HM2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCNX4Q63HM2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCNX4Q63HM2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCNX4Q63HM2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCNX4Q63HM2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCNX4Q63HM2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCNX4Q63HM2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCNX4Q63HM2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCNX4Q63HM2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCNX4Q63HM2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCNX4Q63HM2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCNX4Q63HM2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCNX4Q63HM2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCNX4Q63HM2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCNX4Q63HM2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCNX4Q63HM2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCNX4Q63HM2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCNX4Q63HM2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCNX4Q63HM2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCNX4Q63HM2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCNX4Q63HM2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCNX4Q63HM2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCNX4Q63HM2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCNX4Q63HM2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCNX4Q63HM2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PCNX4Q63HM2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCNX4Q63HM2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCNX4Q63HM2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCNX4Q63HM2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PCNX4Q63HM2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PCNX4Q63HM2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCNX4Q63HM2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCNX4Q63HM2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCNX4Q63HM2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCNX4Q63HM2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCNX4Q63HM2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms