Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CARMIL1Q5VZK9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CARMIL1Q5VZK9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CARMIL1Q5VZK9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
CARMIL1Q5VZK9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CARMIL1Q5VZK9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CARMIL1Q5VZK9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
CARMIL1Q5VZK9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CARMIL1Q5VZK9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
CARMIL1Q5VZK9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CARMIL1Q5VZK9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
CARMIL1Q5VZK9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CARMIL1Q5VZK9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
CARMIL1Q5VZK9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
CARMIL1Q5VZK9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.35
CARMIL1Q5VZK9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
CARMIL1Q5VZK9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
CARMIL1Q5VZK9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CARMIL1Q5VZK9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
CARMIL1Q5VZK9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CARMIL1Q5VZK9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
CARMIL1Q5VZK9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CARMIL1Q5VZK9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC36■■■■□ 3.35
CARMIL1Q5VZK9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CARMIL1Q5VZK9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CARMIL1Q5VZK9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC36■■■■□ 3.35
CARMIL1Q5VZK9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
CARMIL1Q5VZK9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CARMIL1Q5VZK9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
CARMIL1Q5VZK9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CARMIL1Q5VZK9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC36■■■■□ 3.35
CARMIL1Q5VZK9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
CARMIL1Q5VZK9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CARMIL1Q5VZK9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CARMIL1Q5VZK9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CARMIL1Q5VZK9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CARMIL1Q5VZK9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CARMIL1Q5VZK9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
CARMIL1Q5VZK9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CARMIL1Q5VZK9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CARMIL1Q5VZK9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CARMIL1Q5VZK9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CARMIL1Q5VZK9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
CARMIL1Q5VZK9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CARMIL1Q5VZK9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CARMIL1Q5VZK9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
CARMIL1Q5VZK9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CARMIL1Q5VZK9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CARMIL1Q5VZK9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
CARMIL1Q5VZK9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CARMIL1Q5VZK9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CARMIL1Q5VZK9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
CARMIL1Q5VZK9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CARMIL1Q5VZK9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CARMIL1Q5VZK9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
CARMIL1Q5VZK9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CARMIL1Q5VZK9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CARMIL1Q5VZK9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CARMIL1Q5VZK9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CARMIL1Q5VZK9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CARMIL1Q5VZK9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CARMIL1Q5VZK9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CARMIL1Q5VZK9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CARMIL1Q5VZK9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CARMIL1Q5VZK9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CARMIL1Q5VZK9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CARMIL1Q5VZK9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CARMIL1Q5VZK9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CARMIL1Q5VZK9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CARMIL1Q5VZK9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CARMIL1Q5VZK9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CARMIL1Q5VZK9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CARMIL1Q5VZK9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CARMIL1Q5VZK9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CARMIL1Q5VZK9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CARMIL1Q5VZK9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CARMIL1Q5VZK9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CARMIL1Q5VZK9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CARMIL1Q5VZK9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CARMIL1Q5VZK9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CARMIL1Q5VZK9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CARMIL1Q5VZK9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CARMIL1Q5VZK9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CARMIL1Q5VZK9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CARMIL1Q5VZK9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CARMIL1Q5VZK9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CARMIL1Q5VZK9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CARMIL1Q5VZK9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CARMIL1Q5VZK9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CARMIL1Q5VZK9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CARMIL1Q5VZK9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CARMIL1Q5VZK9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
CARMIL1Q5VZK9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CARMIL1Q5VZK9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CARMIL1Q5VZK9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CARMIL1Q5VZK9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CARMIL1Q5VZK9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CARMIL1Q5VZK9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CARMIL1Q5VZK9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CARMIL1Q5VZK9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms