Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUG0

SFMBT2, Scm-like with four MBT domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT2Q5VUG0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SFMBT2Q5VUG0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFMBT2Q5VUG0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms