Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU43

PDE4DIP, Myomegalin, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIPQ5VU43 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDE4DIPQ5VU43 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms