Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT97

SYDE2, Rho GTPase-activating protein SYDE2, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE2Q5VT97 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SYDE2Q5VT97 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYDE2Q5VT97 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYDE2Q5VT97 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYDE2Q5VT97 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYDE2Q5VT97 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYDE2Q5VT97 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYDE2Q5VT97 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYDE2Q5VT97 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYDE2Q5VT97 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SYDE2Q5VT97 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYDE2Q5VT97 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYDE2Q5VT97 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYDE2Q5VT97 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYDE2Q5VT97 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYDE2Q5VT97 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYDE2Q5VT97 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYDE2Q5VT97 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYDE2Q5VT97 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYDE2Q5VT97 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYDE2Q5VT97 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYDE2Q5VT97 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYDE2Q5VT97 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYDE2Q5VT97 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYDE2Q5VT97 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SYDE2Q5VT97 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYDE2Q5VT97 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYDE2Q5VT97 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYDE2Q5VT97 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYDE2Q5VT97 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SYDE2Q5VT97 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYDE2Q5VT97 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYDE2Q5VT97 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYDE2Q5VT97 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYDE2Q5VT97 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SYDE2Q5VT97 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SYDE2Q5VT97 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYDE2Q5VT97 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYDE2Q5VT97 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYDE2Q5VT97 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYDE2Q5VT97 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYDE2Q5VT97 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYDE2Q5VT97 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYDE2Q5VT97 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYDE2Q5VT97 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYDE2Q5VT97 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYDE2Q5VT97 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYDE2Q5VT97 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYDE2Q5VT97 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYDE2Q5VT97 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYDE2Q5VT97 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYDE2Q5VT97 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYDE2Q5VT97 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYDE2Q5VT97 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYDE2Q5VT97 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYDE2Q5VT97 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYDE2Q5VT97 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYDE2Q5VT97 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYDE2Q5VT97 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYDE2Q5VT97 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYDE2Q5VT97 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYDE2Q5VT97 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYDE2Q5VT97 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SYDE2Q5VT97 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SYDE2Q5VT97 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYDE2Q5VT97 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYDE2Q5VT97 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYDE2Q5VT97 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYDE2Q5VT97 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYDE2Q5VT97 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYDE2Q5VT97 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYDE2Q5VT97 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYDE2Q5VT97 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYDE2Q5VT97 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYDE2Q5VT97 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SYDE2Q5VT97 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYDE2Q5VT97 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYDE2Q5VT97 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYDE2Q5VT97 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYDE2Q5VT97 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYDE2Q5VT97 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYDE2Q5VT97 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYDE2Q5VT97 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYDE2Q5VT97 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYDE2Q5VT97 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYDE2Q5VT97 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYDE2Q5VT97 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYDE2Q5VT97 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYDE2Q5VT97 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYDE2Q5VT97 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYDE2Q5VT97 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYDE2Q5VT97 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYDE2Q5VT97 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYDE2Q5VT97 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYDE2Q5VT97 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYDE2Q5VT97 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYDE2Q5VT97 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYDE2Q5VT97 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYDE2Q5VT97 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYDE2Q5VT97 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms