Protein–RNA interactions for Protein: Q5T215

TRAPPC3L, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3LQ5T215 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAPPC3LQ5T215 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAPPC3LQ5T215 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAPPC3LQ5T215 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAPPC3LQ5T215 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAPPC3LQ5T215 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAPPC3LQ5T215 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAPPC3LQ5T215 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAPPC3LQ5T215 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAPPC3LQ5T215 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAPPC3LQ5T215 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAPPC3LQ5T215 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAPPC3LQ5T215 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAPPC3LQ5T215 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAPPC3LQ5T215 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRAPPC3LQ5T215 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRAPPC3LQ5T215 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRAPPC3LQ5T215 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRAPPC3LQ5T215 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRAPPC3LQ5T215 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TRAPPC3LQ5T215 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRAPPC3LQ5T215 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC3LQ5T215 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC3LQ5T215 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms