Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC122Q5T0U0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC122Q5T0U0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC122Q5T0U0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC122Q5T0U0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC122Q5T0U0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC122Q5T0U0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC122Q5T0U0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC122Q5T0U0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC122Q5T0U0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC122Q5T0U0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC122Q5T0U0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC122Q5T0U0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC122Q5T0U0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC122Q5T0U0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC122Q5T0U0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC122Q5T0U0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC122Q5T0U0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC122Q5T0U0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC122Q5T0U0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC122Q5T0U0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC122Q5T0U0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC122Q5T0U0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC122Q5T0U0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC122Q5T0U0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC122Q5T0U0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC122Q5T0U0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC122Q5T0U0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC122Q5T0U0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC122Q5T0U0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC122Q5T0U0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC122Q5T0U0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC122Q5T0U0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC122Q5T0U0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC122Q5T0U0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC122Q5T0U0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC122Q5T0U0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC122Q5T0U0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC122Q5T0U0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC122Q5T0U0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC122Q5T0U0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC122Q5T0U0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC122Q5T0U0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC122Q5T0U0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC122Q5T0U0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC122Q5T0U0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC122Q5T0U0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC122Q5T0U0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC122Q5T0U0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC122Q5T0U0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC122Q5T0U0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC122Q5T0U0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC122Q5T0U0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC122Q5T0U0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC122Q5T0U0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC122Q5T0U0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC122Q5T0U0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms