Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0T0

MARCH8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH8Q5T0T0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MARCH8Q5T0T0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MARCH8Q5T0T0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MARCH8Q5T0T0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MARCH8Q5T0T0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MARCH8Q5T0T0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MARCH8Q5T0T0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MARCH8Q5T0T0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MARCH8Q5T0T0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MARCH8Q5T0T0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MARCH8Q5T0T0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MARCH8Q5T0T0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARCH8Q5T0T0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARCH8Q5T0T0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARCH8Q5T0T0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARCH8Q5T0T0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARCH8Q5T0T0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARCH8Q5T0T0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARCH8Q5T0T0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCH8Q5T0T0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCH8Q5T0T0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCH8Q5T0T0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCH8Q5T0T0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCH8Q5T0T0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCH8Q5T0T0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCH8Q5T0T0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCH8Q5T0T0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCH8Q5T0T0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCH8Q5T0T0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCH8Q5T0T0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCH8Q5T0T0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCH8Q5T0T0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCH8Q5T0T0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCH8Q5T0T0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCH8Q5T0T0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCH8Q5T0T0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCH8Q5T0T0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCH8Q5T0T0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCH8Q5T0T0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCH8Q5T0T0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCH8Q5T0T0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCH8Q5T0T0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCH8Q5T0T0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCH8Q5T0T0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms