Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CEP170Q5SW79 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
CEP170Q5SW79 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CEP170Q5SW79 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CEP170Q5SW79 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CEP170Q5SW79 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
CEP170Q5SW79 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CEP170Q5SW79 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CEP170Q5SW79 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CEP170Q5SW79 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CEP170Q5SW79 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CEP170Q5SW79 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CEP170Q5SW79 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CEP170Q5SW79 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CEP170Q5SW79 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CEP170Q5SW79 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
CEP170Q5SW79 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CEP170Q5SW79 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CEP170Q5SW79 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CEP170Q5SW79 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CEP170Q5SW79 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CEP170Q5SW79 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
CEP170Q5SW79 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CEP170Q5SW79 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CEP170Q5SW79 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CEP170Q5SW79 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CEP170Q5SW79 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CEP170Q5SW79 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CEP170Q5SW79 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CEP170Q5SW79 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CEP170Q5SW79 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
CEP170Q5SW79 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CEP170Q5SW79 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CEP170Q5SW79 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CEP170Q5SW79 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
CEP170Q5SW79 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CEP170Q5SW79 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CEP170Q5SW79 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CEP170Q5SW79 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CEP170Q5SW79 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CEP170Q5SW79 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CEP170Q5SW79 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CEP170Q5SW79 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CEP170Q5SW79 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CEP170Q5SW79 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CEP170Q5SW79 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CEP170Q5SW79 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
CEP170Q5SW79 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CEP170Q5SW79 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CEP170Q5SW79 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
CEP170Q5SW79 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CEP170Q5SW79 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CEP170Q5SW79 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CEP170Q5SW79 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CEP170Q5SW79 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CEP170Q5SW79 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CEP170Q5SW79 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CEP170Q5SW79 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
CEP170Q5SW79 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
CEP170Q5SW79 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CEP170Q5SW79 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CEP170Q5SW79 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CEP170Q5SW79 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CEP170Q5SW79 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CEP170Q5SW79 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CEP170Q5SW79 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CEP170Q5SW79 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CEP170Q5SW79 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CEP170Q5SW79 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
CEP170Q5SW79 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CEP170Q5SW79 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CEP170Q5SW79 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CEP170Q5SW79 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
CEP170Q5SW79 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CEP170Q5SW79 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CEP170Q5SW79 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CEP170Q5SW79 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CEP170Q5SW79 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CEP170Q5SW79 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CEP170Q5SW79 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
CEP170Q5SW79 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CEP170Q5SW79 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CEP170Q5SW79 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CEP170Q5SW79 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CEP170Q5SW79 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CEP170Q5SW79 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CEP170Q5SW79 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CEP170Q5SW79 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CEP170Q5SW79 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CEP170Q5SW79 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CEP170Q5SW79 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CEP170Q5SW79 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CEP170Q5SW79 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CEP170Q5SW79 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CEP170Q5SW79 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CEP170Q5SW79 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CEP170Q5SW79 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CEP170Q5SW79 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
CEP170Q5SW79 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CEP170Q5SW79 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms