Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HP1BP3Q5SSJ5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms