Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms