Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
WDR44Q5JSH3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
WDR44Q5JSH3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR44Q5JSH3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms