Protein–RNA interactions for Protein: Q58FG1

HSP90AA4P, Putative heat shock protein HSP 90-alpha A4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AA4PQ58FG1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSP90AA4PQ58FG1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSP90AA4PQ58FG1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSP90AA4PQ58FG1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSP90AA4PQ58FG1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSP90AA4PQ58FG1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSP90AA4PQ58FG1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSP90AA4PQ58FG1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSP90AA4PQ58FG1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HSP90AA4PQ58FG1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HSP90AA4PQ58FG1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HSP90AA4PQ58FG1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HSP90AA4PQ58FG1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HSP90AA4PQ58FG1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HSP90AA4PQ58FG1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HSP90AA4PQ58FG1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HSP90AA4PQ58FG1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HSP90AA4PQ58FG1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HSP90AA4PQ58FG1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HSP90AA4PQ58FG1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HSP90AA4PQ58FG1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HSP90AA4PQ58FG1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HSP90AA4PQ58FG1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HSP90AA4PQ58FG1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HSP90AA4PQ58FG1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HSP90AA4PQ58FG1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms