Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KHDC3LQ587J8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KHDC3LQ587J8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms